囊肿型痤疮的治疗有三个方面：
第一，口服药，常用的有异维a酸的用法为，根据公斤体重常用的是早晚各吃两片坚持两个月，两个月后减为早晚各一片，可以逐渐改善毛囊皮脂腺的角化状态。
此外还可以使用克拉霉素，抗病原微生物使用一清胶囊，解毒痤疮丸可以清热解毒，排除毒素。
第二，外用药，常用的有夫西地酸软膏，复方多粘菌素b软膏，此类药物是抗病原微生物的药。此外也可以用中药的颠倒散、金黄散等外洗外敷，可以改善局部的炎症状态，改善局部出油的状态。
第三，局部治疗，可以用红蓝光照射，火针点阵激光动力治疗，也是比较好的治疗方法。
